Como instancia de una Pastoral específica, persigue los siguientes fines:

     El procurar una mayor unidad, solidaridad y coordinación en los trabajos, estudios, revisión e intercambio de experiencias pastorales y administrativas de los Santuarios.

     Mediante directrices básicas de una pastoral de conjunto quiere servir de orientador y de ayuda pastoral a todos los Santuarios del Ecuador a la luz del Magisterio de la Iglesia, los documentos de la CELAM y las orientaciones pastorales de la Conferencia Episcopal Ecuatoriana y de la propia Diócesis, según el carisma específico de cada Santuario.

     Se propone a sí mismo, con la ayuda de las Ciencias Humanad (Antropología, Sociología, Psicología, Arqueología) profundizar Teológica y Pastoralmente la realidad de los Santuarios del Ecuador.

     Quiere, por otra parte, estimular para que se estudie pastoralmente a nivel Nacional y Diocesano los diversos fenómenos de la Religiosidad Popular, desde sus mismas raíces, tal como se presentan en nuestros Santuarios de la Sierra, de la Costa, del Oriente y Región Insular, sin descuidar los elementos comunes.

     Formar los agentes de Pastoral de los Santuarios para que asuman en forma consciente el fenómeno de la religiosidad popular de nuestro pueblo, liberándola de los elementos supersticiosos y alienantes, enriqueciéndola con la vivencia profunda, clara del evangelio a través de una catequesis permanente y apropiada.

     Estimular a los pastoralistas, historiadores, psicólogos, teólogos, liturgistas, biblistas, antropólogos… a que publiquen sus estudios y trabajos científicos que ayuden a encontrar nuevas directrices y líneas de la tarea de la nueva evangelización a partir de los santuarios.

     Elaborar el Plan Nacional de Pastoral de Santuarios, de acuerdo con sus propias realidades y necesidades, a partir del Plan Global de la Iglesia en el Ecuador.